Открытие музея предварила концертная программа. В актовом зале семинарии выступил струнный ансамбль Филармонии Якутии Arco Artico, уже давно сотрудничающий с Якутской епархией в качестве гостей и участников проекта «Гармония души».
Сам музей расположился на первом этаже духовно-просветительского комплекса. Пока экспонаты занимают только одно помещение, но, как отметил в приветственном слове ректор семинарии иеромонах Иларион (Варежкин), церковные музеи, церковно-археологические кабинеты, традиционно располагаются в духовных школах и постепенно пополняются.
Значительная часть экспонатов была передана музею епископом Якутским и Ленским Романом из своей личной коллекции и из Якутского епархиального управления.
Многие предметы, вошедшие в число экспонатов, привезены из краеведческих экспедиций: старинные нательные кресты, иконы, богослужебные книги, документы... Особый интерес представляют фотографии храмов — в том числе и не сохранившихся до наших дней.
Отдельный стенд посвящен причту Якутской епархии: фотографии и краткие биографии священно- и церковнослужителей, трудившихся в якутских приходах до революции.
Первую экскурсию по музею провел Валерий Егорович Дмитриев — исследователь церквей в улусах Якутии. Предмет его особой гордости — электронная база по храмам Якутии, в том числе и утраченным. В дальнейшем планируется сделать базу доступной онлайн.
Двери музея открыты для всех желающих.
Стоит отметить, что участники прошедшей международной научно-практической конференции «Святитель Иннокентий (Вениаминов) в судьбах Якутии» в итоговой резолюции предложили Музею истории и культуры народов севера им. Ем. Ярославского совместно со Спасским мужским монастырем города Якутска и Якутской духовной семинарией разработать экскурсионный маршрут, включающий в себя объекты, связанные с жизнью и трудами святителя Иннокентия в Якутске: «Келью святителя Иннокентия» в братском корпусе монастыря, памятник святителю Иннокентию и Музей истории Православия в Якутии на территории семинарии.