На заседании были рассмотрены вопросы, требующие решения в начале каждого учебного года.
Одним из первых был вопрос о замещении вакантной должности проректора по научной работе. По итогам оживленной дискуссии проректором по научной работе был выбран священник Дмитрий Воеца. Заведующим кафедрой Церковной истории назначен священник Михаил Лях.
На Ученом совете утвердили план спецкурс по новым документам Русской Православной Церкви, который был введен в программу семинарии в соответствии с распоряжением Учебного комитета.
Была рассмотрена и принята программа проведения храмового праздника Хабаровской духовной семинарии. На заседании поднимался вопрос и об участии семинарии в региональном этапе Международных Рождественских образовательных чтений.
На Ученом совете рассматривались также вопросы Сектора заочного обучения и обсуждались программы дополнительного образования, которые реализуются на Секторе дополнительного образования. Члены Ученого совета познакомились с планом работы Студенческого совета на 2013–2014 учебный год.